U bentonskoj flori Kornata dosad je utvrdeno 346 biljnih vrsta i nizih sistematskih jedinica. Analiza flore pokazuje apsolutnu prevlast crvenh algi (222 sistematske jedinice), a slijede ih smede alge (72), pa zelene (51).
U biljnom svijetu kornatskih otoka dominira kamenjarska vegetacija. Osnovna je biljna zajednica kadulje i kovilja (Stipo-salvietum) i to njen juzni aspekt s gomorusom (Brachypodium ramosum). Za okomite kornatske stjene izlozene suncu i prskanju mora posebno je zanimljiv i znacajan endem dubrovacka zecina (Centaurea ragusina), a na otoku Mani razvijena je gusta sastojina drvolike mljecike (Euphorbiae dendroides). Slabljenjem ovcarstva oslobadaju se neke povrsine za prirodnu obnovu izvorne sumske vrste - hrasta crnike i njezine zajednice (Orno quercetum ilicis), ali to se dogada samo na lokalitetima s ocuvanom regenerativnom jezgrom.
Otocic Zornik gotovo u cijelosti obrastao je makijskim grmom Pistacia terebinthus.